Frames werden von den meisten Suchmaschinen ignoriert, da sie die jedes Dokument einer Internetseite einzeln in den Suchergebnissen auflisten. Bei der Verwendung von Frames in Webseiten werden innerhalb einer Seite mehrere einzelne Dokumente verwendet, beispielsweise eins für die Navigation und eins für den eigentlichen Inhalt. Da die Suchmaschine diese getrennt erfasst, werden diese auch getrennt in den Suchergebnissen geführt. Kommt ein Internetnutzer nun über das Ergebnis der Suchmaschine zu dem Dokument, welches den Inhalt der Seite enthält, bekommt er diesen zwar angezeigt, kann auf der Seite aber nicht navigieren. Bei der Programmierung suchmaschinenoptimierter Seiten sollte daher auf Frames verzichtet werden. Zur Umgehung dieses Problems kann auch ein Frameloader eingesetzt werden, der dafür sorgt, dass die Seite auch dann, wenn nur über einen Unterframe auf sie zugegriffen wird, alle Frames geladen werden. Siehe Frameloader, Frameset.